Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SPHK2Q9NRA0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SPHK2Q9NRA0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms