Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSU72Q9NP77 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSU72Q9NP77 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms