Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
C20orf27Q9GZN8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
C20orf27Q9GZN8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms