Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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FOXQ1Q9C009 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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FOXQ1Q9C009 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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FOXQ1Q9C009 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXQ1Q9C009 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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