Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRIM54Q9BYV2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM54Q9BYV2 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms