Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms