Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RNF17Q9BXT8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RNF17Q9BXT8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms