Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms