Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EYA3Q99504 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms