Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CICQ96RK0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CICQ96RK0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms