Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC85AQ96PX6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms