Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CNBD2Q96M20 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CNBD2Q96M20 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms