Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
LINC00208Q96KT6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms