Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
LRIG1Q96JA1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms