Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BORCS6Q96GS4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms