Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SCARF2Q96GP6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SCARF2Q96GP6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms