Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIRT1Q96EB6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIRT1Q96EB6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms