Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RNF183Q96D59 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms