Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UPRTQ96BW1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
UPRTQ96BW1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms