Protein–RNA interactions for Protein: Q92859

NEO1, Neogenin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEO1Q92859 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NEO1Q92859 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NEO1Q92859 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms