Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRUQ92729 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRUQ92729 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms