Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERVK_113Q902F9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms