Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DNAAF4Q8WXU2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms