Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX29Q8TEQ0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms