Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CARMIL3Q8ND23 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms