Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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CLIP4Q8N3C7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLIP4Q8N3C7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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