Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC84Q86UT8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC84Q86UT8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms