Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R42Q7Z4L9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms