Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRCQ7RTU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms