Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNDC1Q76NI1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNDC1Q76NI1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms