Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC171Q6TFL3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC171Q6TFL3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms