Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF7Q6Q0C0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms