Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC174Q6PII3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC174Q6PII3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms