Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ANKRD54Q6NXT1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms