Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PERM1Q5SV97 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms