Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RFTN2Q52LD8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RFTN2Q52LD8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms