Protein–RNA interactions for Protein: Q30KQ7

DEFB113, Beta-defensin 113, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFB113Q30KQ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DEFB113Q30KQ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFB113Q30KQ7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms