Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
LAMA3Q16787 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
LAMA3Q16787 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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