Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CLPPQ16740 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CLPPQ16740 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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