Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC010931.3-201ENST00000561647 554 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC018362.1-201ENST00000564805 846 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
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FOXD1Q16676 AC114947.1-201ENST00000511991 432 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD1Q16676 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD1Q16676 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
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