Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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NRF1Q16656 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NRF1Q16656 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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