Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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GRIK4Q16099 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK4Q16099 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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