Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP6AP1Q15904 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP6AP1Q15904 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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