Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SKIV2LQ15477 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SKIV2LQ15477 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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