Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD6Q15008 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMD6Q15008 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
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