Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SHPRHQ149N8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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