Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COL9A3Q14050 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
COL9A3Q14050 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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