Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
KCNC3Q14003 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
KCNC3Q14003 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms