Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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TCOF1Q13428 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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TCOF1Q13428 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCOF1Q13428 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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TCOF1Q13428 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
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TCOF1Q13428 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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TCOF1Q13428 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TCOF1Q13428 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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