Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
NME3Q13232 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NME3Q13232 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
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